कार्बनिक या जैव-जीवाणुनाशक वे जीवाणुनाशक हैं जो गैर-अकार्बनिक स्रोतों जैसे पादप मूल या पशु मूल या जीव हो सकते हैं। कवक और बैक्टीरिया जैसे कई अति परजीवी का उपयोग जैविक या जैव जीवाणुनाशक के रूप में किया जाता है। कुछ परिवारों के बैक्टीरिया और कवक कई फसलों के साथ-साथ मिट्टी में पौधे के रोगजनक बैक्टीरिया को मारने के लिए जाने जाते हैं। बैक्टीरियल रोगों को नियंत्रित करने के लिए इन्हें जैविक कारक भी कहा जाता है। ये बैक्टीरिया या कवक सीधे रोगजनक रोग पैदा करने वाले बैक्टीरिया और कवक को मार सकते हैं, भोजन और रहने के लिए जगह के लिए संघर्ष कर सकते हैं, रोगजनक कवक या बैक्टीरिया को मारने के लिए विषाक्त पदार्थों को छोड़ सकते हैं।