जैव-कवकनाशी कवकनाशी ऐसे होते हैं जो गैर-अकार्बनिक स्रोतों जैसे पादप मूल या पशु मूल या शायद जीवों से होते हैं। कवक और बैक्टीरिया जैसे कई अतिपरजीवी का उपयोग जैविक या जैव कवकनाशी के रूप में किया जाता है। कुछ परिवारों के बैक्टीरिया और कवक कई फसलों के साथ-साथ मिट्टी में पौधे के रोगजनक कवक को मारने के लिए जाने जाते हैं। फंगल रोगों को नियंत्रित करने के लिए इन्हें जैविक कारक भी कहा जाता है। ये बैक्टीरिया या कवक सीधे रोगजनक रोग पैदा करने वाले कवक को मार सकते हैं, भोजन और रहने के लिए जगह के लिए संघर्ष कर सकते हैं, और रोगजनक कवक या बैक्टीरिया को मारने के लिए विषाक्त पदार्थ छोड़ सकते हैं।